一套完整的分子蒸馏设备主要包括：分子蒸发器、脱气系统、进料系统、加热系统、冷却真空系统和控制系统。分子蒸馏装置的核心部分是分子蒸发器，其种类主要有3种：(1)降膜式：为早期形式，结构简单，但由于液膜厚，效率差，当今世界各国很少采用；(2)刮膜式:形成的液膜薄，分离效率高，但较降膜式结构复杂；(3)离心式：离心力成膜，膜薄，蒸发效率高，但结构复杂，真空密封较难，设备的制造成本高。为提高分离效率，往往需要采用多级串联使用而实现不同物质的多级分离。 分子蒸馏过程可发如下四步： 分子从液相主体向蒸发表面扩散 通常，液相中的扩散速度是控制分子蒸馏速度的主要因素，所以应尽量减薄液层厚度及强化液层的流动。 分子在液层表面上的自由蒸发 蒸发速度随着温度的升高而上升，但分离因素有时却随着温度的升高而降低，所以，应以被加工物质的热稳定性为前提，选择经济合理的蒸馏温度。 分子从蒸发表面向冷凝面飞射 蒸气分子从蒸发面向冷凝面飞射的过程中，可能彼此相互碰撞，也可能和残存于两面之间的空气分子发生碰撞。由于蒸发分子远重于空气分子，且大都具有相同的运动方向，所以它们自身碰撞对飞射方向和蒸发速度影响不大。而残气分子在两面间呈杂乱无章的热运动状态，故残气分子数目的多少是影响飞射方向和蒸发速度的主要因素。 分子在冷凝面上冷凝 只要保证冷热两面间有足够的温度差（一般为70~100℃），冷凝表面的形式合理且光滑则认为冷凝步骤可以在瞬间完成，所以选择合理冷凝器的形式相当重要。

制药行业对药用氮有很高的要求，这需要高纯度的氮才能满足生产需求。医用制氮机不同于其他制氮机。制药行业的国际GMP标准规定，与药物和液体接触的部件均由不锈钢制成，并且必须经过消毒。氮气发生器必须由不锈钢制成，并且氮气出口必须配备无菌过滤器和其他设备。由于制药厂对制氮机的高要求，制药制氮机通常采用高配置。随着GMP标准的提高，许多制氮机行业也在着手解决这一问题，并且可以理解，有许多符合市场标准的高纯度医用制氮机。医疗用高纯度氮气发生器。在制氮制剂，生物工程中的纯氮分离，高容量输液，水输液，粉剂输液，冻干剂等制剂的生产中，广泛用于充氮和灌封的合成药物中。 当前，在制药生产中有三种供应氮气的方式：从钢瓶，液态氮和药用制氮机中供应氮。 (1)钢瓶供给的氮气纯度低(通常为99.5%至99.9%)，并且含有诸如微生物和热原等有害杂质，因此不能保证对GMP验证氮气的要求。无菌产品要求无尘，无微生物和无热原，因此很难保证钢瓶提供的氮气。氮是非常昂贵的，需要更多的劳动力和大量存储，并且使用不方便。 (2)液氮的纯度可能表示工艺要求，但在包装和运输过程中，纯度可能由于设备，配件，材料等的污染而降低。同时，在准备诸如管道之类的设备和更换储罐时，难以确认安装，清洁和消毒，并且存在诸如氮微生物和热源以及液氮纯度和粉尘含量之类的不确定物品。该量也难以保证对GMP验证的要求，并且氮的成本相对较高。 (3)高纯度医用制氮机共有3种：压缩空气处理系统，PSA制氮系统，除尘除氮，除臭和杀菌净化系统。制氮机采用低碳奥氏体不锈钢容器管和密封外壳，先进而完整的制氮技术以及独特而简单的结构设计。氮净化过滤器组包括高效灰尘过滤器，高效除臭过滤器和高效细菌过滤器。处理后，产品氮可以达到干燥(露点<-45°C)，无油(油含量<0.001ppm)，过滤精度0.01um，无味和无菌，细菌和噬菌体的100%过滤。符合无菌制剂生产的cGMP要求。